轉基因大豆與普通大豆的區別，僅在于轉基因大豆中的基因序列里被人為引入了可抵抗殺蟲劑、除草劑或者是病蟲害的基因片段，對大豆本身的營養成分并不構成影響。迄今為止，不安全說在科學上仍然沒有得到證實。然而暫時也很難證明轉基因的絕對安全性。但盡管爭論還沒有結果，大家在選購時還是要注重從各個方面去綜合衡量轉基因大豆油的質量和可食性。