在懷孕早期，引起流產的原因很多。其中胚胎自身的因素，大約5成～6成是胚胎的染色體異常造成的。

此外，還有準媽媽自身的因素，內分泌失調會使黃體功能不足，從而導致孕早期流產。而說甲狀腺功能低下、妊娠期糖尿病等內分泌疾病也可導致流產的發生。其他的全身性疾病感染，產后的高血壓、心衰、腎臟的疾病。或者說生殖道本身畸形，比如說他子宮有縱隔、畸形，也容易流產。

另外，還有一些外因可導致懷孕早期的流程。例如準媽發生摔倒、碰撞的情況或在同房時造成刺激等。一些不良的生活習慣，吸煙、酗酒、吸毒，這些都有可能會引起流產。還有環境因素。比如說有毒有害的氣體，裝修的甲醛含量超標，也有可能會引起流產，甚至噪聲，還有輻射比較多，治療的放射線接觸的比較多，也有可能會引起。