子宮內膜異位癥的治療可以通過藥物進行治療，因為患有子宮內膜異位癥后，異常的子宮內膜會對卵巢內分泌有反應，所以采用性激素治療已成為本病的重要治療方法。性激素治療主要是抑制排卵或引起閉經，使異位內膜發生退行性變，繼而壞死、吸收。但是激素治療雖然能緩解癥狀，但是產生的副反應是不容忽視的，如食欲減退、惡心、肝功能不正常等。

除了進行藥物治療，子宮內膜異位癥的治療還可以通過手術手段，一般醫生對子宮內膜異位癥不太嚴重的患者首先會考慮藥物治療，但是沒有什么效果后就要進行手術治療，手術可分為保守性、根治性和半保守性3種，具體要采用哪一種治療方法，這還的根據患者病情及患者的要求來選擇，子宮內膜異位癥容易復發，所以選擇治療方法時一定要權衡所有的利弊關系，注意做好子宮內膜異位癥診斷。