藥物治療的目的主要是抑制卵巢功能，造成假孕或假絕經狀態等。

子宮內膜異位癥的藥物治療

子宮內膜異位癥的病因不清，目前尚無根治的藥物。因為子宮內膜異位癥是激素依賴性疾病，所以藥物治療的目的主要是抑制卵巢功能，造成假孕或假絕經狀態，減少內異癥病灶的活性以及減少粘連的形成，緩解疼痛，抑制術后殘余病灶，預防復發，縮短復發的間期。促進生育。

可供選擇的藥物主要有四類，主要的副作用如下:

1、口服避孕藥:連續或周期用藥6個月，副作用較少，可有消化道癥狀或肝功能異常等。

2、孕激素:主要是突破性出血、乳房脹痛、體重增加、消化道癥狀以及肝功能異常等。

3、孕三酮:主要是雄激素樣作用，如毛發增多、聲音變粗、面部痤瘡、體重增加、肝功異常。

4、GnRHa:年輕需要生育的患者首選此藥治療3~6個月，副作用主要是由于低雌激素血癥引起潮熱、陰道干燥、性欲下降、失眠及抑郁等，長期應用可引起骨質疏松。