子宮腺肌病的患者因為宮腔內膜和子宮肌層中的病灶直接相連，所以普遍認為子宮腺肌病是因為基底層的子宮內膜侵襲進入肌層發(fā)生生長所造成的疾病。和子宮腺肌病的發(fā)病密切相關的原因有人工流產、多次妊娠和分娩、慢性子宮內膜炎等原因造成的子宮內膜基底層損傷。

因為內膜基地層失去了粘膜下層，所以內膜會直接和肌層相接觸，缺少了粘膜下層的親密保護，會讓子宮內膜更加容易侵入肌層。

患有子宮腺肌病的患者通常還會合并子宮內膜增生和子宮肌瘤，通常會提示高水平的雌孕激素的刺激，這可能也是促進內膜往內部肌層生長原因。異位的內膜在子宮肌層大多都是彌漫性生長，往往會累及后壁，所以子宮往往會很均勻的增大。整個子宮呈一個球型，前后徑都會增大。因為子宮腺肌病的患者會在局部反復的出血，所以病灶周圍的纖維組織會增生，導致與周圍肌層沒有明顯界限，手術時候往往難以剝離出。