腸道菌群失調通常會有一些癥狀表現。通過這些癥狀，患者會到醫院進行檢查。醫生會根據相應癥狀開具一些具體的檢查事項，然后在根據檢查的結果進行診斷。這個時候就需要患者積極配合。

1、通過對菌群的定性分析。通過糞便可以發現葡萄球菌有大量生長，并且有很多的中性多形核細胞。如果有白色念珠菌感染的腸炎，可以取病理進行涂片，鏡檢中可以看到卵圓形的白色念珠菌。菌群的定量檢查，這個需要將分制平均分話，然后按一定的比例進行稀釋。在培養菌進行培養后，來計算各類的細胞菌落數。這種方式比較麻煩，一般很少采用。

2、腸道出現一些病癥，這時就需要進行結腸鏡檢查，可以檢查出腸粘膜會有充血，水腫，血管分支模糊不清。有的會有糜爛或者潰瘍，還可以看到黃色的假膜覆著。通過這些手段進行檢查，能夠檢查出腸道中的各種疾病，并及時的進行治療。腸道疾病要重視，不然會引起消化道各種的病變反應，對身體各機能都會有所損害，也不利于身體的正常運行。