在古代時，人們對瘧疾束手無策。很多人把瘧疾歸為天災。甚至在古代出現了放血療法來治療瘧疾，但是瘧疾原蟲是一種會在血液紅細胞內繁殖擴散的蟲體，所以本身患者感染了瘧疾就非常容易導致貧血，這種放血療法簡單粗暴只會增快患者的死亡速度。隨著現代科學技術的發展，瘧疾也已經有了相應的治療方法，大極大的降低了對人類的危害。

感染瘧疾之后患者在發作期，包括退熱之后，需臥床休息24小時，注意給患者多補充水分，飲食應多吃流質半流質食物，高蛋白食物為主。如果有腹瀉嘔吐的現象適當給患者進行補液，造成貧血的患者需要補充鐵劑來補血。寒戰期做好保暖工作，注意做好隔離工作。此為瘧疾感染后的基礎治療。

在感染瘧疾之后進入紅內期時，需使用藥物控制原蟲，還要將紅外期的原蟲進行殺滅，防止瘧疾復發。

如果患者的情況兇險，治療時應以搶救為原則，其立即對瘧原蟲進行殺滅。進一步改善患者的微循環，以防止內皮細胞在毛細血管中崩裂的這種現象，注意維持患者的水電平衡。