卡介苗接種方法主要有三種，分別為皮內注射法、皮上劃痕法以及口服法。其中皮內注射法是比較常見的，與普通疫苗的注射方法相同，不過部位略有偏差。一般是上臂三角肌外側，采用的是皮內注射，嚴禁皮下或是肌內注射。

第二種是皮上劃痕法，它所用的卡介苗是乳白色混懸液，每1ml內含菌量50-75mg。方法是在左上臂三角肌下端外緣，用酒精消毒皮膚，干后滴2-3滴搖勻的菌苗，再用消毒的針劃“井”字，各長1-1 5cm，間隙0.5cm，以出現紅痕為宜。后涂勻菌苗，使其滲入皮內，菌苗干后才可穿衣服。

這種方法操作簡單，易于普及和推廣，局部反應輕，淋巴結反應較少。

第三種是口服法，因為只只用于2個月以內的嬰兒，所以不多見。

這三種方法中，皮內注射法和口服法的效果會比較好，皮上劃痕法效果相對就差一下。