由于沙眼會傳染，因此家長需要及時識別孩子得沙眼的癥狀，及早隔離治療。由于沙眼多為急性發病，得了沙眼的孩子會覺得眼中有異物，同時會怕光線，容易流淚，還有很多粘液或粘液性分泌物，數周后急性癥狀消退，進入慢性期，此時可無任何不適或僅覺眼易疲勞，如于此時治愈或自愈，可不留瘢痕，但在慢性病程中，于流行地區，常有重復感染，病情加重，角膜上有活動性血管翳時，刺激癥狀變為顯著，視力減退，晚期常因后遺癥，如瞼內翻，倒睫，角膜潰瘍及眼球干燥等，癥狀更為明顯，并嚴重影響視力，甚至失明。

沙眼有分輕度和重度兩種情況。但沙眼剛開始病發時，輕度沙眼，患者僅有發癢、異物感及少量分泌物。重癥沙眼特別是角膜受累或有其他并發癥時，則出現畏光、流淚、疼痛等刺激癥狀；視力減退情況，常與角膜受累程度有關。

隨著沙眼不斷惡化，具體癥狀會體現為：首先孩子結膜充血、肥厚、正常透明性消失；乳頭肥大，結膜面粗糙；濾泡增殖，角膜血管翳，即在角膜上緣出現新生血管向角膜內伸入，由上向下發展如垂簾狀，嚴重時可侵犯全角膜；形成瘢痕，隨著炎癥吸收，結締組織增生，瞼結膜則完全被瘢痕所代替。
沙眼會讓孩子感覺不適，沙眼惡化后也會帶來許多并發癥。沙眼的并發癥有：急性結膜炎、慢性淚囊炎和淚道阻塞、沙眼性角膜炎及角膜潰瘍。后遺癥有：倒睫及瞼內翻，角膜混濁，瞼球粘連等。